Pedro Montt fue, en repetidas ocasiones, opositor a la forma de acción de los miembros del Congreso, pues las obstrucciones de las minorías, de la Alianza o la Coalición -formada por el Partido Conservador, nacionales y algunas agrupaciones liberales- hicieron muchas veces imposible una gestión de gobierno adecuada y productiva. Siendo Ministro del Interior, por ejemplo, expresaba que "en un gobierno parlamentario, cuya base es el respeto y el sometimiento a la voluntad de la mayoría, ¿Qué es más correcto y conveniente? ¿Que se haga lo que una Cámara, casi por unanimidad quiere, o que se haga lo que quieren cuatro de sus miembros?".

Un factor que acentuó el desorden administrativo fue la forma en que el Congreso Nacional discutía y aprobaba los presupuestos anuales de la nación. Un año antes de que Pedro Montt llegara a la presidencia, el político participaba de la idea de limitar la iniciativa del parlamento en materia de gastos públicos. Pese a sus críticas, según Juan Eduardo Vargas, Pedro Montt indicaba que estaba "muy distante de pensar que la situación de verdadera desorganización administrativa se debe a ese sistema (el parlamentario). Los abusos a que ha dado lugar este sistema en cuya corrección debemos todos empeñarnos, no justifican la condenación del sistema en sí mismo, ni mucho menos justifican que, a favor de esta condenación se quiera llegar a otro que, no la voluntad de muchos, sino la de uno sólo fuera la que impera en el país".