Eugenio Pereira escribió numerosos estudios monográficos sobre diferentes ámbitos del folklore y la cultura popular chilena, como los cantos populares de la Patria Vieja, el tema de los Siete Pares de Francia en la poesía popular chilena, o la vida del famoso bandido decimonónico Pancho Falcato, los que hasta hoy se encuentran dispersos en distintas revistas especializadas y folletos.

En 1952, publicó una completa Guía bibliográfica para el estudio del folklore chileno, de gran valor para los historiadores de la cultura popular, en la que dio a conocer trabajos que de otra manera habrían quedado en el olvido.