Como bloque político, la Concertación no ha estado exenta de diferencias internas, aunque en su historia ha primado el esfuerzo por la unidad. Dichas diferencias responden a las características propias de cada proyecto particular de los partidos que la integran, sobre todo de los dos grandes polos que la componen: el Partido Socialista y el Partido Demócrata Cristiano. El primero lidera un proyecto político que pone énfasis en el ámbito de lo social, siendo el centro de éste el desarrollo de políticas sociales, tendencia que se ha manifestado en los gobiernos de Ricardo Lagos y Michelle Bachelet. El segundo, el Partido Demócrata Cristiano, tiende a conciliarlos en términos económicos, sociales y políticos. Así lo demuestran los dos gobiernos en los que ha estado a la cabeza: el de Aylwin y el de Frei Ruiz-Tagle, durante los cuales el acento estuvo puesto en la reconstrucción democrática y la consolidación del modelo neoliberal de desarrollo económico.