Junto con especializarse en el período indiano, Néstor Meza también publicó dos estudios sobre los precedentes del proceso independentista: La actividad política del Reino de Chile entre 1806 y 1810 (1957) y "La permanencia en la monarquía como problema político del Reino de Chile desde la constitución de la primera Junta, el 18 de septiembre de 1810, hasta la disolución del primer Congreso Nacional, el 15 de noviembre de 1811" (1972).