En 1886 regresó a Chile José Toribio Medina con un valioso material documental obtenido en el archivo de Simancas y en el de Indias de Sevilla. Con el objetivo de dar a conocer este gran caudal de papeles y fuentes, que a su juicio debía completar y modificar el conocimiento de la historia colonial chilena, Medina inició una nueva colección documental que tituló Colección de documentos inéditos para la historia de Chile. Entre 1888 y 1902 el autor alcanzó a editar los treinta volúmenes de ésta colección. Posteriormente, a partir de 1956, el fondo histórico y bibliográfico José Toribio Medina adicionó otros siete volúmenes.