En 1876, el Instituto Agrícola reemplazó a la Escuela Práctica de Agricultura dependiente de la Sociedad Nacional de Agricultura. A través del Instituto, el Estado y no la universidad era quien otorgaba el título de ingeniero agrónomo.

El Instituto se sustentó en una planta docente de extranjeros debido a que no existían profesionales especializados en Chile que pudieran enseñar técnicas agrarias científicas y especializadas. En este contexto, el francés René Leuvre fue su primer director, el veterinario Juan Besnard enseñaba zootecnia y ganadería y el alemán Federico Philippi enseñaba botánica.

En 1928 el Instituto Agrícola pasó a formar parte de Facultad de Agronomía y Veterinaria de la Universidad de Chile. En 1934 se ubicó en el Palacio de Versailles hasta 1970 cuando se trasladó al Campus Antumapu en La Pintana.