La historia de las ideas fue uno de los campos de estudio desarrollados con especial entusiasmo por Walter Hanisch. Los temas que trató fueron diversos, y abarcan la historia de la filosofía y la teología durante el período colonial, las ideas políticas durante la Independencia, y el pensamiento de Andrés Bello, entre otros. De entre sus obras dedicadas al tema, destacan En torno a la filosofía en Chile (1594-1810) (1963), El catecismo político-cristiano: las ideas y la época: 1810 (1970), y Tres dimensiones del pensamiento de Bello: religión, filosofía, historia (1965).